CSIC / UAM

El mayor interés de nuestro laboratorio es poder contribuir al conocimiento sobre los mecanismos por los que la expression génica es controlada en Leishmania. Nuestro grupo ha venido trabajando en la identificación tanto de elementos reguladores en cis, frecuentemente localizados en regions 3’ no traducidas (3’-UTRs), como de proteínas de unión a RNA (RBPs), como determinantes clave de la regulación de la expresión génica. Sin embargo, una dificultad importante con la que nos hemos encontrado es la deficiente anotación que presentan las bases de datos del genoma de Leishmania, las 5’- y 3’-UTRs no se encuentran definidas. Afortunadamente, los avances recientes en la tecnología de secuenciación permiten abordar de forma eficiente la definición en gran detalle de los transcriptomas. En esta dirección, en colaboración con la Unidad de Genómica y Secuenciación masiva del CBMSO, dirigida por la Dra. Begoña Aguado, estamos definiendo los transcriptomas completes de Leishmania major y otras especies de Leishmania mediante la secuenciación masiva de RNA (RNA-Seq). Disponer de esta información es clave para la identificación de los elementos funcionales en los mRNAs y para establecer la regulación temporal de la expresión génica en los diferentes estadios del desarrollo de este parásito


Publicaciones
  • Dataset for distribution of SIDER2 elements in the Leishmania major genome and transcriptome, Jose M. Requena, Alberto Rastrojo, Esther Garde, Manuel C. López, M. Carmen Thomas, Begoña Aguado. Data in Brief. 2017

  • Genomic cartography and proposal of nomenclature for the repeated, interspersed elements of the Leishmania major SIDER2 family and identification of SIDER2-containing transcripts, Jose M. Requena, Alberto Rastrojo, Esther Garde, Manuel C. López, M. Carmen Thomas, Begoña Aguado. Molecular and Biochemical Parasitology. 2017

  • Transcriptionally Driven DNA Replication Program of the Human Parasite Leishmania major, Rodrigo Lombraña, Alba Álvarez, José Miguel Fernández-Justel, Ricardo Almeida, César Poza-Carrión, Fábia Gomes, Arturo Calzada, José María Requena, María Gómez. Cell Reports. 2016


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    Contacto

    Regulación de la expresión génica en Leishmania
    Centro de Biología Molecular Severo Ochoa
    CSIC / UAM
    Madrid (Spain)

    José María Requena Rolanía
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